《管理办法》明确，采矿权人在生产过程中应做到“谁开发、谁修复，边开采、边修复”，应严格按照审查通过的《方案》履行矿山地质环境保护与土地复垦义务，制定矿山年度生态修复计划，依据计划逐年开展矿山生态修复工作，确保生态修复工程与矿产资源开采活动同步开展。
《管理办法》要求，新设立采矿权人应取得采矿许可证后1个月内建立基金账户；已开采矿山应在本办法施行之日起1个月内建立或完善基金账户；服务年限在三年以下（含三年）的矿山，在设定基金账户后，对《方案》确定的修复总投资额一次性计提，存入基金账户。服务年限在三年以上的矿山，对《方案》确定的修复总投资额可分期计提，存入基金账户，第一次计提数额不得少于总投资额的20%，余额按年度分摊；矿山关闭前一年完成全部基金计提。
《管理办法》同时明确，基金主要用于《方案》确定的因矿产资源勘查开采活动造成的矿区地面塌陷、地裂缝、崩塌、滑坡、泥石流、地形地貌景观破坏、地下含水层破坏、地表植被损毁的预防和治理、土地复垦、矿山开采影响范围定界、监测管护等生态修复工作。采矿权转让的，原采矿权人已计提的结余基金以及未履行完成矿山生态修复义务，由原采矿权人与受让人在转让合同中约定。转让后，受让人应当继续按照本办法计提基金。
此外，《管理办法》还要求，各级自然资源主管部门按照“双随机一公开”的方式，对采矿权人履行矿山生态修复义务情况开展随机抽查，每年抽查比例不少于其登记权限范围内在建与生产矿山的10%。应当编制《方案》而未编制的；涉及重大变更未重新编制《方案》并经原审批机关批准的；未按照批准的《方案》开展生态修复工作的；在矿山被批准关闭、闭坑前未完成修复责任的将被责令限期改正，并列入矿业权人异常名录或严重违法名单。
